Biote

Le biote est l’ensemble des organismes présents dans un espace et pendant une période déterminés. Il comprend les animaux, les végétaux, les champignons et les microorganismes, qu’ils soient résidents ou temporairement observés. En écologie aquatique, parler du biote d’un lac, d’un bassin versant ou d’un sédiment impose donc de préciser les limites spatiales, temporelles et méthodologiques de l’inventaire.

Portée du terme

Le biote désigne une composante vivante prise collectivement. Il peut être subdivisé en groupes fonctionnels ou taxonomiques, comme le phytoplancton, le zoobenthos ou la faune piscicole. Il ne comprend pas les paramètres physicochimiques du milieu, mais ceux-ci influencent sa composition et son activité.

Le terme est proche de biocénose, qui insiste davantage sur une communauté d’organismes coexistant et interagissant dans un milieu. Dans l’usage scientifique, les deux mots peuvent se recouvrir ; la définition opératoire adoptée doit être indiquée. Le habitat, lui, désigne les conditions et ressources utilisées par un organisme ou une population, et non l’ensemble des êtres vivants qui y sont recensés.

Inventaire et comparaison

Un inventaire ne révèle qu’une partie du biote : maillage des filets, saison, profondeur, effort d’échantillonnage et méthode d’identification modifient les organismes détectés. Une comparaison entre sites exige donc des protocoles compatibles et une couverture suffisante. L’absence d’observation d’un taxon n’établit pas nécessairement son absence réelle.