Caryotype
Le caryotype est la description ordonnée du complément chromosomique d’une cellule, d’un individu ou d’une espèce. Il indique le nombre de chromosomes et leur répartition selon la taille, la position du centromère et des repères visibles. Par extension, le mot désigne aussi l’image où les chromosomes d’une métaphase sont appariés et classés.
Établissement du caryotype
Les chromosomes sont le plus souvent observés en métaphase, stade où ils sont fortement condensés et séparables. Chez les poissons, les préparations peuvent provenir de tissus à forte activité mitotique, par exemple rein antérieur, branchies, gonades, embryons ou cultures cellulaires selon l’objectif. Un traitement hypotonique disperse les chromosomes, puis la fixation et la coloration rendent leur contour visible.
Les homologues sont regroupés par paires selon leur longueur, leur rapport de bras et la position du centromère. Le nombre diploïde s’écrit 2n ; le nombre de bras chromosomiques peut être résumé par un nombre fondamental. Des colorations de bandes et l’hybridation in situ fluorescente ajoutent des repères tels que l’hétérochromatine, les régions organisatrices du nucléole, l’ADN ribosomal ou les télomères.
Portée biologique
Le caryotype révèle une aneuploïdie, une polyploïdie ou certains remaniements de grande taille, notamment fusions, fissions et translocations. Chez les poissons, il éclaire l’évolution chromosomique, les systèmes de chromosomes sexuels, l’hybridation et les duplications du génome. Deux espèces peuvent partager le même 2n tout en différant par la proportion de chromosomes métacentriques ou acrocentriques et par la localisation de séquences répétées.
Une seule métaphase peut présenter des chromosomes superposés, perdus ou excessivement contractés. Une description fiable repose donc sur plusieurs cellules et, si possible, plusieurs individus. Un caryotype conventionnel ne détecte pas la plupart des substitutions nucléotidiques, les petites insertions ou certaines variations équilibrées ; les méthodes moléculaires et le séquençage apportent une résolution complémentaire.