Saprotrophie

La saprotrophie est un mode de nutrition dans lequel un organisme tire carbone, énergie et nutriments de matière organique morte. Les champignons et de nombreuses bactéries saprotrophes libèrent des enzymes hors de leurs cellules, décomposent les macromolécules du substrat, puis absorbent les produits solubles. Le terme décrit le processus nutritionnel ; saprophyte est un ancien nom d’organisme souvent remplacé par saprotrophe.

Décomposition extracellulaire

La cellulose, les protéines, les lipides et d’autres constituants de la matière organique sont trop volumineux pour être absorbés directement. Des enzymes extracellulaires les hydrolysent en molécules plus petites. La composition du substrat, l’oxygène, la température, le pH et les interactions microbiennes déterminent la vitesse et les voies de décomposition.

Rôle dans les milieux aquatiques

Dans les sédiments, les débris végétaux, les aliments non consommés et les fèces, les saprotrophes participent à la reminéralisation des nutriments. Leur activité alimente les réseaux microbiens, mais une dégradation rapide peut aussi accroître la consommation d’oxygène. Dans un biofilm, saprotrophes, producteurs primaires et consommateurs microscopiques échangent des métabolites à très courte distance.

La saprotrophie se distingue du parasitisme sur un hôte vivant et de la biotrophie, mais ces catégories ne sont pas toujours exclusives à l’échelle d’une espèce : certains microorganismes changent de stratégie selon leur stade ou les ressources disponibles.