Homoplasie
Une homoplasie est une ressemblance entre caractères qui ne s’explique pas par leur transmission depuis l’ancêtre commun le plus récent des organismes comparés. Elle peut résulter d’une convergence, d’une évolution parallèle ou d’une réversion vers un état ancestral. Sa reconnaissance dépend toujours d’une hypothèse de parenté et d’une définition précise du caractère.
Origines possibles
Une convergence produit des états ressemblants dans des lignées distinctes soumises à des contraintes fonctionnelles ou environnementales comparables. L’évolution parallèle décrit des transformations semblables à partir d’états initiaux proches ; la frontière avec la convergence varie selon l’échelle d’analyse. Une réversion correspond au retour apparent à un état antérieur. Ces processus peuvent concerner la morphologie, le comportement ou des positions de séquences moléculaires.
Conséquences pour l’analyse
En phylogénétique, une homoplasie peut faire regrouper à tort des lignées si elle est interprétée comme un caractère hérité en commun. Sa détection suppose de coder les états de caractères, de les replacer sur un arbre et de comparer plusieurs scénarios d’évolution. L’indice de cohérence ou d’autres mesures résument l’ajustement des caractères à un arbre, sans révéler à eux seuls le mécanisme responsable.
L’homoplasie n’est pas seulement un « bruit » méthodologique. Sa répétition peut signaler des contraintes de développement, des possibilités morphologiques limitées ou une sélection comparable. Elle ne doit toutefois être invoquée qu’après avoir écarté une erreur d’identification, un mauvais alignement ou une hypothèse d’homologie mal définie.