Polymorphe

En génétique des populations, un locus est polymorphe lorsque plusieurs allèles y sont présents dans la population étudiée. « Polymorphe » peut aussi qualifier un caractère ou une population présentant plusieurs formes discrètes. Le terme décrit une variation, sans indiquer à lui seul sa cause, son maintien ni son effet biologique.

Seuils de fréquence

Certaines définitions historiques exigeaient que l’allèle le plus fréquent ne dépasse pas 95 ou 99 %. Ces seuils étaient utiles avec des marqueurs peu nombreux, mais ne constituent pas une règle universelle. Avec le séquençage, un site peut être dit polymorphe dès qu’au moins deux états sont observés, tandis qu’une analyse peut imposer une fréquence allélique minimale pour écarter les variants rares.

Interprétation

Le résultat dépend de l’échantillon : aire, période, effectif, stade et méthode de génotypage. Un locus polymorphe dans une population peut être monomorphe dans une autre. La présence de plusieurs allèles ne démontre ni sélection ni adaptation ; dérive, migration, mutation et histoire démographique peuvent produire le motif. Toute publication doit donc annoncer le seuil, les données manquantes et la population de référence.