Sélection combinée

La sélection combinée associe la performance propre d’un candidat et les performances de ses apparentés pour estimer sa valeur génétique. Les informations sont pondérées selon leur précision et leur parenté avec le candidat. En aquaculture, cette méthode cherche à distinguer la part transmissible d’un caractère des effets du milieu, plutôt qu’à retenir uniquement les poissons présentant la meilleure mesure individuelle.

Combiner des informations

Le phénotype d’un poisson renseigne sur son patrimoine génétique et sur les conditions dans lesquelles il a grandi. La moyenne de sa famille apporte une autre information, parce que des apparentés partagent une partie de leurs variants génétiques. Les deux mesures ne sont toutefois pas indépendantes ; leur combinaison demande de tenir compte de leurs relations.

La sélection combinée se distingue ainsi d’une sélection individuelle fondée sur le seul phénotype propre. Elle se distingue aussi d’une simple succession de seuils, où l’on retiendrait d’abord certaines familles puis les plus grands poissons de chacune. Une telle procédure ne reproduit pas nécessairement les pondérations d’une évaluation combinée.

Conditions de comparaison

L’information des apparentés est utile lorsqu’une mesure est peu précise chez un seul individu ou ne peut pas être recueillie sur le futur reproducteur. Les caractères mesurés après abattage, par exemple, peuvent être observés sur des collatéraux. L’utilité exacte de chaque source dépend du caractère, de son héritabilité et du dispositif de mesure.

Des familles élevées dans des bacs distincts peuvent partager un effet de milieu autant qu’un effet génétique. Une différence de croissance entre familles ne démontre donc pas, à elle seule, une différence de valeur transmissible. La conception expérimentale, l’identification des individus et les modèles d’évaluation servent à séparer ces composantes.

Gain et diversité

Les simulations aquacoles montrent que le mode de sélection, les effets de milieu commun et les accouplements influencent conjointement le gain et la consanguinité. Le choix des candidats ne s’évalue donc pas séparément des contributions parentales à la génération suivante.

Le mot combinée concerne ici les sources d’information individuelle et familiale. Un index multicaractère répond à une autre question : il pondère plusieurs objectifs, comme la croissance et la qualité du produit. Les deux dimensions peuvent coexister dans un programme, mais ne sont pas interchangeables.

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