Acétogenèse

L’acétogenèse est une étape microbienne de la digestion anaérobie au cours de laquelle des produits fermentaires sont convertis principalement en acétate, dioxyde de carbone et dihydrogène. Elle se situe généralement après l’acidogenèse et avant la production biologique de méthane.

Transformations microbiennes

Les bactéries acétogènes oxydent notamment le propionate, le butyrate et certains alcools. Plusieurs de ces réactions ne libèrent que peu d’énergie et deviennent favorables lorsque la pression partielle de dihydrogène reste basse. Des microorganismes consommateurs de dihydrogène, en particulier des archées méthanogènes, entretiennent cette condition. Cette coopération métabolique est appelée syntrophie.

Le terme couvre aussi l’acétogenèse réductrice, dans laquelle des bactéries utilisent du dioxyde de carbone et du dihydrogène pour former de l’acétate par la voie de Wood-Ljungdahl. Ce processus ne doit pas être confondu avec toutes les fermentations produisant fortuitement de l’acétate.

Importance dans les systèmes aquatiques

Dans un digesteur, un sédiment ou une zone anoxique chargée en matière organique, l’acétogenèse prépare des substrats utilisables par la fermentation méthanique. Une accumulation d’acides gras volatils peut traduire un déséquilibre entre leur production et leur consommation. La température, le pH, la disponibilité des accepteurs d’électrons et les échanges de métabolites entre communautés déterminent alors le flux de carbone.