Gène de prédisposition à une maladie
Un gène de prédisposition à une maladie est un gène dont certains variants modifient la probabilité de développer cette maladie. Il n’est généralement ni nécessaire ni suffisant pour provoquer l’affection : l’effet dépend d’autres loci, de l’environnement, de l’âge, du sexe et des expositions infectieuses ou zootechniques.
Risque et causalité
La prédisposition se quantifie par une différence de risque ou d’odds entre génotypes dans une population définie. Un variant fréquent à faible effet peut contribuer à un caractère polygénique ; un variant rare à forte pénétrance augmente davantage le risque sans garantir la maladie.
Une association statistique ne prouve pas que le gène mesuré est causal. Le variant peut seulement être corrélé à la véritable cause par déséquilibre de liaison. La réplication, l’analyse fonctionnelle et la prise en compte de la structure génétique sont indispensables.
Chez les poissons d’élevage, température, densité, qualité de l’eau, alimentation et pression infectieuse peuvent modifier l’expression du risque. Un test génétique ne remplace donc ni le diagnostic vétérinaire ni la prévention sanitaire. Son usage en sélection doit également surveiller la diversité génétique et les effets défavorables corrélés.
Références
- National Human Genome Research Institute. Genetic predisposition. https://www.genome.gov/genetics-glossary/Genetic-Predisposition
- Tam V et al. Benefits and limitations of genome-wide association studies. Nature Reviews Genetics. 2019;20:467-484. 10.1038/s41576-019-0127-1
