Généalogie

Une généalogie décrit les relations de parenté entre individus au fil des générations. Elle est souvent représentée par un pedigree, diagramme reliant parents et progéniture. En élevage aquacole, elle sert à suivre les croisements, estimer la consanguinité, gérer la diversité génétique et analyser la transmission de caractères.

Construction et usage

Une généalogie documentée associe à chaque individu un identifiant unique, ses parents présumés ou confirmés, sa cohorte et les événements de reproduction. Les liens peuvent provenir d’observations d’accouplement, de lots séparés ou d’assignations génétiques réalisées avec des marqueurs.

Le pedigree permet de calculer le coefficient de consanguinité et d’organiser les accouplements afin de limiter l’apparentement entre reproducteurs. Il constitue aussi une base pour la sélection familiale et pour la séparation des effets génétiques et des effets du milieu dans l’évaluation des performances.

Limites

Une erreur de filiation se propage dans tous les calculs descendants. Les pontes collectives, la fécondation multiple et les mélanges de larves rendent souvent l’observation insuffisante chez les poissons. La robustesse d’une assignation génétique dépend du nombre et du polymorphisme des marqueurs, des erreurs de génotypage, de la proportion de parents candidats échantillonnés et du modèle d’accouplement.

Une généalogie d’individus se distingue d’un arbre phylogénétique, lequel représente des relations évolutives entre lignées ou taxons.