Plantes

Le mot « plantes » peut désigner les plantes terrestres, ou Embryophytes, ou un ensemble plus large comprenant les algues vertes, les Viridiplantae. Dans certaines classifications, Plantae possède encore une autre portée. Le terme rassemble donc des usages botaniques, phylogénétiques et écologiques dont les limites ne se déduisent pas du seul nom. En milieu aquatique, « plante » n’est notamment pas synonyme de tout organisme photosynthétique.

Plantes terrestres et lignées vertes

Les plantes terrestres comprennent les bryophytes, les lycophytes, les fougères et leurs proches, les gymnospermes et les angiospermes. Elles appartiennent à une lignée évolutive liée aux algues streptophytes. Le qualificatif « terrestre » désigne ici un groupe : plusieurs de ses représentants vivent dans l’eau.

Les analyses de la One Thousand Plant Transcriptomes Initiative portent sur les relations entre les lignées de plantes vertes. Elles permettent de situer les plantes terrestres parmi des groupes plus larges, plutôt que de les opposer à toutes les algues comme si celles-ci constituaient une seule catégorie extérieure.

Les Viridiplantae comprennent les lignées vertes ; les Archaeplastida englobent également les algues rouges et les glaucophytes dans les usages phylogénétiques correspondants. Ces périmètres ne sont pas interchangeables. Un registre qui emploie Plantae pour un royaume large ne décrit pas nécessairement les seules Embryophytes.

Photosynthèse et classement

La photosynthèse oxygénique est caractéristique de nombreuses plantes, mais ne suffit pas à définir une parenté. Les cyanobactéries sont des bactéries, tandis que les diatomées et les algues brunes appartiennent à d’autres lignées eucaryotes. Le partage d’une fonction n’entraîne donc pas l’appartenance au même groupe taxonomique.

Inversement, la perte de fonctions photosynthétiques dans certaines lignées végétales ne fait pas disparaître leur histoire évolutive. Le classement repose sur des relations de descendance et des caractères comparés, plutôt que sur la seule couleur verte d’un organisme observé.

La classification APGIV concerne les plantes à fleurs. Elle décrit leurs ordres et leurs familles, sans constituer une classification de toutes les plantes vertes ni de l’ensemble des organismes appelés algues. Son périmètre est donc complémentaire de celui des études phylogénomiques plus larges.

Usage écologique dans les milieux aquatiques

En écologie, des regroupements fonctionnels facilitent la description du milieu. Les macrophytes rassemblent des végétaux visibles à l’œil nu, avec une portée qui peut inclure des plantes vasculaires, des bryophytes et certaines grandes algues. Ce regroupement n’a pas pour objectif de réunir un seul clade.

Les expressions « plantes aquatiques », « algues » et « phytoplancton » répondent ainsi à des questions différentes : parenté, forme de vie ou position dans la colonne d’eau. Une description associe le sens utilisé au taxon ou au contexte, sans imposer à tous ces mots un royaume unique. Cette distinction est particulièrement utile pour les inventaires de biodiversité et les descriptions d’habitats.