Virus

Un virus est une entité génétique dont le cycle de multiplication dépend d’une cellule hôte et dont la lignée évolutive est associée à la production d’un virion ou dérive d’ancêtres qui en produisaient. Il ne possède pas de métabolisme énergétique autonome ni de machinerie complète de traduction. Sa multiplication mobilise donc des constituants de la cellule infectée.

Génome et particule virale

Le génome viral peut être constitué d’ADN ou d’ARN, simple ou double brin, en une ou plusieurs molécules linéaires ou circulaires. Cette diversité est une propriété des différentes lignées : un virion individuel ne contient pas simultanément un génome d’ADN et un génome d’ARN comme matériel héréditaire principal.

Le virion est la particule extracellulaire produite pour transmettre le génome. Il comporte généralement une capside protéique et peut porter une enveloppe lipidique acquise à partir d’une membrane cellulaire. Certains virus classés par leur ascendance ont perdu la capacité de former une capside. À l’inverse, les viroïdes, satellites et viriformes appartiennent à la virosphère mais répondent à des définitions distinctes dans la classification de l’International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV).

Cycle dans la cellule

L’attachement à un récepteur, l’entrée, la libération du génome, sa réplication, l’expression des protéines virales, l’assemblage et la sortie constituent les grandes étapes d’un cycle productif. Leur ordre et leurs mécanismes varient. Certains génomes persistent sous forme intégrée ou extrachromosomique et peuvent alterner latence et réplication. Cette persistance n’est ni universelle ni synonyme d’absence définitive d’activité.

Les virus infectent des animaux, plantes, champignons, protistes, bactéries et archées. Leur gamme d’hôtes et leur tropisme cellulaire dépendent de facteurs d’entrée mais aussi de la compatibilité des mécanismes intracellulaires et des défenses de l’hôte.

Virus et maladie des poissons

La détection d’un acide nucléique viral démontre la présence de la cible recherchée, pas nécessairement la cause des lésions. Le diagnostic d’une maladie virale associe le contexte épidémiologique, les signes cliniques, les lésions, la distribution du virus dans les tissus et une méthode validée. Chez les poissons, la température, l’espèce, l’âge et le statut immunitaire modulent fortement l’expression de nombreuses infections.