Banque de gènes

Une banque de gènes est une collection organisée de ressources biologiques conservées avec leur identité et leur origine afin de maintenir un patrimoine génétique utilisable. Chez les organismes aquatiques, elle peut réunir des reproducteurs vivants, du sperme, des embryons, des tissus, des cellules, des cultures ou de l’ADN. Elle soutient la conservation, la recherche et la sélection sans reproduire à elle seule une population naturelle.

Formes de conservation

Une banque in vivo maintient des animaux, des végétaux aquatiques, des algues ou des microorganismes vivants. Une banque in vitro conserve du matériel isolé, souvent par cryoconservation. Les protocoles sont opérationnels pour le sperme de nombreuses espèces de poissons, mais la taille, la richesse en vitellus et la faible perméabilité des ovocytes et des embryons rendent leur conservation beaucoup plus difficile. Tissus, cellules germinales et cellules souches constituent d’autres voies en développement.

Une semence issue d’un mâle ne porte que sa contribution haploïde. Une collection limitée au sperme ne reconstitue donc ni le génome mitochondrial maternel ni toute la diversité d’une population. Les banques vivantes et les collections de matériels complémentaires répondent à des objectifs génétiques différents.

Qualité et traçabilité

La diversité réellement représentée dépend du nombre de donneurs, de leur parenté, de la structure des populations échantillonnées et de la qualité du matériel. L’identification taxonomique, la provenance, la date, le statut sanitaire, le protocole de préparation, l’emplacement de stockage et les résultats de viabilité forment le contexte traçable de chaque échantillon. Sans ces informations, une collection conserve de la matière biologique mais perd une part de sa valeur génétique.

Une banque destinée au séquençage peut se satisfaire d’ADN non viable. Une banque conçue pour produire des descendants exige au contraire des cellules ou gamètes fonctionnels, des essais après décongélation et une représentation suffisante des lignées.

Place dans la conservation

La banque de gènes relève de la conservation ex situ. Elle peut sécuriser une souche d’élevage, réduire la dérive génétique entre générations, soutenir un programme de sélection ou fournir du matériel à la recherche. Elle ne préserve toutefois ni les interactions écologiques, ni les adaptations qui continuent d’évoluer dans l’habitat, ni les causes ayant entraîné le déclin d’une population.