Endofaune
L’endofaune réunit les animaux qui vivent dans l’épaisseur d’un sédiment, par opposition à l’épifaune installée à sa surface. Elle comprend notamment des annélides, des mollusques et des crustacés fouisseurs, en milieu marin comme en eau douce. Le terme décrit une position dans le substrat et non un groupe taxonomique ni une classe de taille.
Rôle écologique et mesure
En creusant, ingérant ou ventilant le sédiment, les organismes endobenthiques déplacent des particules et de l’eau interstitielle. Cette bioturbation modifie la pénétration de l’oxygène, les gradients chimiques, la décomposition de la matière organique et les flux de nutriments. L’endofaune constitue aussi une ressource alimentaire pour de nombreux poissons démersaux.
Sa composition varie avec la granulométrie, la teneur en matière organique, la salinité, l’hydrodynamisme et l’oxygénation. Les animaux profonds ou très petits échappent plus facilement aux prélèvements superficiels ou aux tamis à large maille. Les densités obtenues par benne, carottier ou drague ne sont donc comparables que pour des surfaces, profondeurs de pénétration, mailles et modes de conservation compatibles.