Expression génique

L’expression génique est l’ensemble des processus par lesquels l’information d’un gène contribue à la production d’un ARN fonctionnel ou d’une protéine. Pour un gène codant une protéine, elle comprend la transcription de l’ADN en ARN, la maturation éventuelle du transcrit, sa traduction et les étapes qui règlent la stabilité ou l’activité du produit.

Régulation

L’accessibilité de l’ADN, les séquences régulatrices et les facteurs de transcription modulent le recrutement de l’ARN polymérase. Après la transcription, l’épissage, l’export, la dégradation des ARN, l’efficacité de traduction et la dégradation des protéines ajoutent d’autres niveaux de contrôle. Un même génome produit ainsi des profils d’expression différents selon le type cellulaire, le stade de développement et l’environnement.

Mesure et interprétation

La quantité d’ARN messager peut être mesurée par PCR quantitative ou séquençage, tandis que les protéines nécessitent d’autres approches. Une variation d’ARN n’implique pas automatiquement une variation équivalente de protéine ou d’activité biologique. Chez les poissons, température, salinité, alimentation, infection et stress peuvent modifier rapidement certains profils. L’expression relative d’un gène est interprétée par rapport à des témoins, un tissu, un moment d’échantillonnage et des gènes de référence stables. Elle décrit une réponse moléculaire, mais ne démontre pas à elle seule une relation causale avec un état clinique.