Protozoaire

Protozoaire est un terme historique et fonctionnel appliqué à divers eucaryotes unicellulaires, souvent mobiles et hétérotrophes. Il ne désigne pas un groupe naturel unique dans les classifications phylogénétiques actuelles. En aquaculture et en santé des poissons, le mot reste employé pour des organismes libres, symbiotiques ou parasites très différents ; « unicellulaire » ne suffit donc pas à identifier leur parenté ni leur rôle.

Un ensemble non taxonomique

Les organismes autrefois réunis parmi les Protozoa sont répartis dans plusieurs lignées eucaryotes, notamment des Alveolata, Amoebozoa, Rhizaria, Discoba ou Stramenopiles. Ils peuvent se déplacer à l’aide de cils, de flagelles, de pseudopodes ou être peu mobiles. Certaines espèces réalisent la photosynthèse ou combinent plusieurs modes trophiques, ce qui rend l’opposition traditionnelle entre « protozoaires animaux » et algues insuffisante.

Le terme reste pratique pour décrire une organisation unicellulaire ou une catégorie d’observation, mais un nom de taxon apporte une information phylogénétique plus précise. Tous les micro-organismes ne sont pas des protozoaires : les bactéries sont procaryotes, tandis que les champignons microscopiques et de nombreuses algues appartiennent à d’autres ensembles eucaryotes.

En pathologie piscicole, des ciliés, flagellés et autres protistes peuvent être parasites, mais leur présence dans un prélèvement ne démontre pas nécessairement qu’ils causent les lésions observées. Leur identification combine la morphologie, le site de prélèvement, le cycle biologique et, selon le taxon, des méthodes moléculaires.