Synapomorphie
Une synapomorphie est un état dérivé d’un caractère, partagé par plusieurs taxons parce qu’ils l’ont hérité de leur ancêtre commun. Elle constitue une preuve potentielle de leur appartenance à un même clade. Son interprétation est relative au groupe comparé et à l’arbre retenu : un caractère n’est pas synapomorphique dans tous les contextes.
Caractère dérivé partagé
Un caractère peut présenter plusieurs états au cours de l’évolution. L’état ancestral est une plésiomorphie ; un état transformé apparu ultérieurement est une apomorphie. Lorsque plusieurs lignées héritent du même état apomorphe de leur ancêtre commun, cet état constitue une synapomorphie pour le groupe qu’elles forment.
La même structure peut être une synapomorphie à un niveau de l’arbre et un caractère ancestral à un niveau plus restreint. La qualification exige donc un groupe de référence, des groupes externes permettant d’estimer la polarité du caractère et une hypothèse phylogénétique.
Rôle dans l’inférence
Les synapomorphies soutiennent l’hypothèse de monophylie d’un groupe. Elles peuvent être anatomiques, développementales, comportementales ou moléculaires. Une synapomorphie diagnostique n’est pas nécessairement visible chez tous les descendants : elle peut avoir été secondairement modifiée ou perdue dans certaines lignées.
Une ressemblance ne constitue pas automatiquement une synapomorphie. Si des états semblables sont apparus indépendamment ou résultent d’une réversion, il s’agit d’une homoplasie. Les analyses confrontent donc plusieurs caractères et évaluent leur congruence plutôt que de déduire un clade d’un trait isolé.
Limites et interprétation
Identifier une synapomorphie est une hypothèse historique, non une simple observation descriptive. Elle dépend du codage des états, de l’échantillonnage et de la reconstruction des transformations sur l’arbre. Une révision phylogénétique peut modifier la branche à laquelle l’origine d’un caractère est attribuée, sans remettre en cause l’observation du caractère lui-même.
Références
- Wiley E. O. et Lieberman B. S. (2011). Phylogenetics: Theory and Practice of Phylogenetic Systematics, 2e éd. Wiley-Blackwell. https://doi.org/10.1002/9781118017883
- Turjak M. et Trontelj P. (2012). « A method for measuring support for synapomorphy using character state distributions on phylogenetic trees ». Cladistics, 28, 627–638. https://doi.org/10.1111/j.1096-0031.2012.00403.x